摘要：在植物基因組中,葉綠體DNA (cpDNA)序列可以向核基因組轉(zhuǎn)移成為核質(zhì)體DNA (NUPT)。NUPTs在植物染色體(包括性染色體)的演化過程中具有重要作用,但目前相關(guān)研究比較缺乏。以雌雄異株植物石刁柏(Asparagus officinalis)為材料,采用生物信息學(xué)方法對(duì)其核基因組NUPTs進(jìn)行注釋及分析,并選取葉綠體基因組反向重復(fù)區(qū)(IR) 2個(gè)片段進(jìn)行染色體定位。結(jié)果表明,石刁柏核基因組中有2 239個(gè)NUPTs序列的插入,總長度為565 970 bp,占核基因組的0.047%。不同染色體上插入的NUPTs數(shù)量存在較大差異, Y染色體上的NUPTs數(shù)量、密度及總長度均高于其它染色體,表明NUPTs在石刁柏性(Y)染色體上累積的更多。石刁柏葉綠體基因組中的IR區(qū)、大單拷貝區(qū)(LSC)和小單拷貝區(qū)(SSC)序列均能夠向核基因組轉(zhuǎn)移,但I(xiàn)R區(qū)序列轉(zhuǎn)移頻率更高。此外,對(duì)2個(gè)IR區(qū)的葉綠體序列進(jìn)行熒光原位雜交,其中AocpIR1主要分布在所有染色體的著絲粒部位,而AocpIR2特異性分布在Y染色體上。研究結(jié)果為深入揭示石刁柏基因組的結(jié)構(gòu)及其性染色體的演化奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ).
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