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DNA條形碼在熱帶龍腦香科樹種鑒定中的應(yīng)用

摘要:龍腦香科植物是東南亞地區(qū)重要的熱帶木材來源樹種,對其開展DNA條形碼評估在林業(yè)監(jiān)管及森林資源保護(hù)等方面具有非常重要的實(shí)際應(yīng)用價值。通過對龍腦香科植物樣品進(jìn)行rbcL、matK、trnL-trnF和ITS2四個片段的擴(kuò)增和測序,結(jié)合GenBank下載的數(shù)據(jù),共獲得龍腦香科樹種14屬244種共計899條序列。通過比較4個片段的通用性、序列特征、種內(nèi)和種間的遺傳變異,基于Best Match (BM)、Best Close Match (BCM)、相似性搜索算法(BLAST)和鄰接樹(NJ) 4種方法評估DNA條形碼對于龍腦香科樹種的鑒定能力。結(jié)果表明, ITS2在龍腦香科樹種中鑒定效率最高,通過優(yōu)化的擴(kuò)增體系能夠從該科植物葉片中獲得較高質(zhì)量的ITS2片段;葉綠體matK片段擴(kuò)增和測序效率為100%,且種內(nèi)及種間遺傳變異明顯,鑒定成功率高于其它葉綠體片段,并據(jù)此提出ITS2和matK適合作為龍腦香科樹種的DNA條形碼。

關(guān)鍵詞:
  • 龍腦香科  
  • dna條形碼  
  • its2  
  • matk  
  • 熱帶地區(qū)  
作者:
胡建霖; 劉志芳; 慈秀芹; 李捷
單位:
中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園綜合保護(hù)中心; 植物系統(tǒng)發(fā)育與保護(hù)生物學(xué)實(shí)驗室; 昆明650223; 中國科學(xué)院大學(xué); 北京100049
刊名:
植物學(xué)報

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期刊名稱:植物學(xué)報

植物學(xué)報緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:11-5705/Q。堅持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1983年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。