摘要:為了篩選出一個(gè)或多個(gè)適宜研究環(huán)境DNA(environmental DNA,eDNA)的魚類通用引物,本實(shí)驗(yàn)選取了5對引物,分別對魚類線粒體細(xì)胞色素b(Cytochromeb,Cytb)基因、16SrDNA和細(xì)胞色素c氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因部分片段進(jìn)行擴(kuò)增。在對兩個(gè)水樣eDNA進(jìn)行擴(kuò)增后發(fā)現(xiàn),引物CY45M和1634M均擴(kuò)增出目的條帶,且擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)量適用于后續(xù)的高通量測序,而引物CYFM、16ACM和COⅠM均沒有擴(kuò)增出目的條帶。繼續(xù)對另外7個(gè)水樣eDNA擴(kuò)增后發(fā)現(xiàn),引物CY45M和1634M在所有水樣eDNA中均取得良好的擴(kuò)增效果。對目的產(chǎn)物進(jìn)行IlluminaMiseq測序后發(fā)現(xiàn),引物CY45M和1634M擴(kuò)增產(chǎn)物注釋上的魚類物種均為11種,二者獲得的魚類種類既存在差異也存在重復(fù)。綜上所述,引物CY45M和1634M都可作為魚類群落結(jié)構(gòu)eDNA研究的通用引物。
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