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實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)巴西孢子絲菌的實(shí)驗(yàn)方法的建立

摘要:目的建立一種快速、特異、靈敏的熒光PCR方法檢測(cè)巴西孢子絲菌。方法比對(duì)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中所有巴西孢子絲菌內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)序列,在保守區(qū)域設(shè)計(jì)并合成特異性引物和探針,建立并優(yōu)化熒光PCR檢測(cè)方法。對(duì)優(yōu)化后的方法使用標(biāo)準(zhǔn)濃度核酸進(jìn)行擴(kuò)增效率、靈敏度及特異度評(píng)價(jià)。通過(guò)巴西孢子絲菌小鼠感染模型,與組織培養(yǎng)比較,對(duì)本研究中的方法進(jìn)行評(píng)價(jià)。結(jié)果建立的實(shí)時(shí)熒光PCR方法對(duì)巴西孢子絲菌的檢測(cè)限為100fg。該方法對(duì)申克孢子絲菌、球形孢子絲菌、其他常見(jiàn)致病真菌28種、常見(jiàn)細(xì)菌3種以及人類基因組和小鼠基因組擴(kuò)增結(jié)果均為陰性,特異度為100%。對(duì)巴西孢子絲菌感染小鼠腦、肝、肺、脾、腎及淋巴結(jié)檢測(cè)與培養(yǎng)結(jié)果相一致。結(jié)論本研究建立的熒光PCR方法可快速、靈敏、特異地鑒定巴西孢子絲菌,并能夠有效的對(duì)感染小鼠模型標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),有助于孢子絲菌病的早期特異性病原學(xué)診斷。

關(guān)鍵詞:
  • 實(shí)時(shí)熒光pcr  
  • 巴西孢子絲菌  
  • 鑒定  
  • 感染動(dòng)物模型  
作者:
張明瑞; 周盈; 李福秋; 姚春麗; 楊鑫; 龔杰; 趙飛
單位:
吉林大學(xué)第二醫(yī)院皮膚科; 長(zhǎng)春130022; 長(zhǎng)春市中心醫(yī)院; 長(zhǎng)春130051; 中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所; 北京102206
刊名:
中國(guó)真菌學(xué)

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中國(guó)真菌學(xué)雜志緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:31-1960/R。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于2006年,雜志在全國(guó)同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。