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插入序列IS6100介導(dǎo)DNA序列轉(zhuǎn)移的機制研究

摘要:目的插入序列IS6100與耐藥基因轉(zhuǎn)移密切相關(guān),本研究旨在初步探究IS6100轉(zhuǎn)移DNA序列的機制。方法以Genbank庫中已有序列中含兩個及兩個以上拷貝IS6100序列的質(zhì)?;蛘呷旧w為研究對象,通過生物信息分析的方法分析各IS6100側(cè)翼的靶位點重復(fù)序列(TSD),推測該元件轉(zhuǎn)座酶可能的工作機制。結(jié)果共檢索到22條序列,含5條染色體、16條質(zhì)粒以及1條定位未知的轉(zhuǎn)座子序列。其中有13條序列(59%)來自鞘脂菌屬細(xì)菌,余下均來自條件致病菌的染色體或質(zhì)粒。在鞘脂菌屬細(xì)菌TKS中,IS6100拷貝數(shù)可多達29個,且IS6100和鞘脂菌屬細(xì)菌基因組的GC%均接近60%。共有35條不同的8bpTSD在這些菌株中出現(xiàn)的頻率為2~8次。TSD的GC%含量在13%~100%,有87%(30/35)的TSD序列GC%含量均≥50%。這些TSD可同時出現(xiàn)在同一菌株的染色體或質(zhì)粒內(nèi)部、同一菌株的染色體和質(zhì)粒之間、不同菌株的染色體和質(zhì)粒間。結(jié)論IS6100的產(chǎn)生菌可能為鞘脂菌屬細(xì)菌。IS6100的作用靶位點沒有高度選擇性,但仍傾向作用于高GC%含量位點。兩個IS6100可以形成復(fù)合轉(zhuǎn)座子,轉(zhuǎn)移其間的DNA序列,這些轉(zhuǎn)座事件可以發(fā)生在分子間和分子內(nèi)。

關(guān)鍵詞:
  • dna轉(zhuǎn)座子  
  • 基因轉(zhuǎn)移  
  • 水平  
  • is6100  
  • 耐藥機制  
作者:
聶璐; 吳奎海; 陳文靜; 李煒煊
單位:
佛山市第一人民醫(yī)院檢驗科; 廣東528000
刊名:
中國醫(yī)藥生物技術(shù)

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