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鱖彈狀病毒TaqMan熒光定量PCR檢測方法的建立及應(yīng)用

摘要:為建立快速、準(zhǔn)確檢測鱖彈狀病毒(SCRV)的TaqMan熒光定量PCR方法,本實驗根據(jù)彈狀病毒N基因中的保守序列,設(shè)計合成了一對特異性引物和TaqMan探針,以構(gòu)建的標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒為模板,經(jīng)條件優(yōu)化后建立了SCRV的TaqMan熒光定量PCR檢測方法,并對該方法的特異性、敏感性和重復(fù)性進(jìn)行試驗。結(jié)果顯示,建立的TaqMan熒光定量PCR檢測方法標(biāo)準(zhǔn)曲線的相關(guān)系數(shù)為0.999,質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品在1×10~8拷貝/μL~1×10~1拷貝/μL范圍內(nèi)有較好的線性關(guān)系;該方法可以特異性檢測SCRV,但對草魚出血病病毒(GCRV)、錦鯉皰疹病毒(KHV)、羅非魚湖病毒(TiLV)、石斑魚虹彩病毒(SGIV)、傳染性脾腎壞死病(ISKNV)、神經(jīng)壞死病毒(NNV)及鯉春病毒血癥病毒(SVCV)等7種常見魚類病毒檢測結(jié)果均為陰性;最低可檢測到的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品濃度為102拷貝/μL,比常規(guī)PCR方法靈敏100倍;該方法組內(nèi)與組間變異系數(shù)均小于2%。采用該方法對35份臨床樣品進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示陽性檢出率為31%,而普通PCR陽性檢出率為14%,該方法檢出率比常規(guī)PCR高。本研究建立的SCRV的TaqMan熒光定量PCR檢測方法為SCRV的快速檢測提供了可行的技術(shù)手段。

關(guān)鍵詞:
  • 鱖魚彈狀病毒  
  • n基因  
  • taqman熒光定量pcr  
作者:
梁紅茹; 蔡秀珠; 范芷儀; 林強(qiáng); 付小哲; 劉禮輝; 黃志斌; 牛銀杰; 林蠡; 李寧求
單位:
中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所農(nóng)業(yè)農(nóng)村部漁用藥物創(chuàng)制重點實驗室/廣東省水產(chǎn)動物免疫技術(shù)重點實驗室; 廣東廣州510380; 仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院動物科技學(xué)院; 廣東廣州570228
刊名:
中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報

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