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吉氏巴貝斯蟲多個(gè)GPI錨定蛋白基因的篩選與生物信息學(xué)分析

摘要:吉氏巴貝斯蟲是一類紅細(xì)胞內(nèi)專性寄生的血液原蟲,犬一旦感染終生帶蟲,治療后時(shí)有復(fù)發(fā),因此需要簡(jiǎn)便快捷的臨床診斷方法及時(shí)確診治療。GPI錨定蛋白是蟲體表面重要的抗原分子,是很好的潛在診斷標(biāo)識(shí),在蟲體粘附、識(shí)別以及入侵紅細(xì)胞等過程中具有非常重要的作用。為了篩選吉氏巴貝斯蟲GPI錨定蛋白基因,通過搜索NCBI、Uniprot以及PiroplasmaDB數(shù)據(jù)庫中吉氏巴貝斯蟲表面抗原,與武漢株吉氏巴貝斯蟲數(shù)據(jù)庫作比對(duì),篩選出可能的吉氏巴貝斯蟲武漢株的GPI錨定蛋白基因,并通過bigPI、PredGPI、GPI-SOM網(wǎng)站預(yù)測(cè)其GPI錨定位點(diǎn)。運(yùn)用生物信息學(xué)分析軟件預(yù)測(cè)其氨基酸信號(hào)肽、跨膜區(qū)、疏水區(qū)以及結(jié)構(gòu)域和抗原表位等,分析其生物信息特性。通過分析確定了5個(gè)吉氏巴貝斯蟲武漢株的GPI候選抗原,分別命名為BgP50-WH、BgP47-WH、BgP45-WH、BgP32-WH、BgP12-WH,其GPI錨定位點(diǎn)均位于C端,長(zhǎng)度約為21~22個(gè)氨基酸,均有信號(hào)肽并含有4個(gè)抗原表位。分析結(jié)果表明,這5個(gè)GPI抗原均有望成為吉氏巴貝斯病的診斷標(biāo)識(shí),其中BgP47-WH和BgP50-WH與抗體親和力最強(qiáng),最具有成為診斷標(biāo)識(shí)的潛力。

關(guān)鍵詞:
  • 吉氏巴貝斯蟲  
  • gpi錨定蛋白  
  • 生物信息學(xué)  
  • 免疫原性  
作者:
戰(zhàn)雪燕; 聶政; 趙陽楠; 羅曉瑩; 李慕曉; 安曉夢(mèng); 敖陽思琦; 崔杰; 王森; 賀蘭; 趙俊龍
單位:
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院; 武漢430070
刊名:
中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào)

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中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:31-2031/S。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1993年,在全國(guó)同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。