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長江中游常見魚類DNA條形碼研究及其電子芯片分析

摘要:為建立長江中游常見魚類的快速鑒別方法,文獻(xiàn)調(diào)研了7目11科50屬64種魚類名錄,GenBank共獲取168條線粒體細(xì)胞色素c氧化酶Ⅰ(COⅠ)序列,分析了序列特征、不同階元Kimura-2-paramater (K2P)遺傳距離及系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系.結(jié)果 顯示,64種魚類的種間遺傳距離(平均值為0.084)明顯大于種內(nèi)(平均值為0.0079),NJ樹上不同物種均能以較高支持度聚類成獨(dú)立分支,以線粒體COⅠ序列作為DNA條形碼可準(zhǔn)確鑒定所研究魚類;綜合利用分子生物學(xué)軟件篩選物種特異性探針,最終43種魚類可篩選出112條物種特異性探針,物種識(shí)別率為67.2%.本研究驗(yàn)證了DNA條形碼芯片技術(shù)在長江中游魚類物種鑒定的可行性,可為該地區(qū)魚類物種多樣性保護(hù)提供技術(shù)支持.

關(guān)鍵詞:
  • 長江中游  
  • dna條形碼  
  • 電子芯片  
作者:
郜星晨; 姜偉; 劉紹平
單位:
中國長江三峽集團(tuán)有限公司中華鱘研究所; 三峽工程魚類資源保護(hù)湖北省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 宜昌443100; 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部長江中上游漁業(yè)資源環(huán)境科學(xué)觀測實(shí)驗(yàn)站; 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院長江水產(chǎn)研究所; 武漢430223
刊名:
漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展

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漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展雜志緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號(hào)為:37-1466/S。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1980年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。