摘要：目的利用生物信息學(xué)分析胰腺癌發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵基因,為胰腺癌的早期診斷、預(yù)后評估及靶向治療提供理論依據(jù)。方法從GEO數(shù)據(jù)庫中獲取GSE15471基因芯片數(shù)據(jù)集,在線分析工具GEO2R篩選差異表達(dá)基因,并對差異表達(dá)基因進(jìn)行GO、KEGG富集分析和蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析,利用Cytoscape軟件的cytoHubba插件篩選出關(guān)鍵基因,通過GEPIA數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵基因再次驗證。結(jié)果從GSE15471基因芯片中共篩選出267個顯著差異表達(dá)基因,其中上調(diào)基因232個,下調(diào)基因35個。富集分析顯示差異表達(dá)基因主要涉及細(xì)胞黏附、PI 3K-Akt信號通路、蛋白水解、炎性反應(yīng)、膠原分解代謝、免疫反應(yīng)等。通過蛋白互作網(wǎng)絡(luò)篩選出11個關(guān)鍵基因,下調(diào)基因ALB、EGF,上調(diào)基因MMP2、CXCL8、FN1、COL1A1、SPP1、MMP1、ITGA2、COL3A1、CRP。GEPIA數(shù)據(jù)庫中關(guān)鍵基因表達(dá)情況與基因芯片分析結(jié)果一致,生存分析顯示胰腺癌患者總生存時間與MMP1、ITGA2基因表達(dá)高低相關(guān)。結(jié)論生物信息學(xué)篩選出的11個關(guān)鍵基因在胰腺癌的發(fā)生、發(fā)展中有重要作用,是潛在的胰腺癌特異腫瘤分子學(xué)標(biāo)志物和靶向治療新位點。
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