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雨生紅球藻UVR8的基因克隆和生物信息學(xué)分析

摘要:【目的】獲得雨生紅球藻中紫外抗性蛋白(Uvresistance locus 8,UVR8)的cDNA序列全長,并進(jìn)行生物信息分析?!痉椒ā恳杂晟t球藻為研究對(duì)象,通過同源克隆方法獲得紫外抗性蛋白UVR8的cDNA序列全長,并通過生物信息手段對(duì)其理化性質(zhì)、蛋白結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化進(jìn)行分析。【結(jié)果】序列分析表明,HaeUVR8的編碼區(qū)全長為1554 bp,共編碼517個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)理論等電點(diǎn)為5.56,理論分子量為54.31 kD。通過BLASTp分析,與擬南芥中UVR8的相似性達(dá)到51%,與萊菌衣藻中UVR8的相似性達(dá)到59%。通過蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析,HaeUVR8蛋白中存在UVR8蛋白的典型結(jié)構(gòu)域,包括7個(gè)葉片螺旋結(jié)構(gòu)和保守的色氨酸殘基。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,高等植物和真核綠藻來源UVR8s有共同祖先?!窘Y(jié)論】本研究首次獲得雨生紅球藻中編碼UVR8的基因序列,發(fā)現(xiàn)其結(jié)構(gòu)與高等植物UVR8相似,暗示二者可能有相似的作用機(jī)制,為雨生紅球藻中UVR8的表達(dá)、功能研究奠定基礎(chǔ),同時(shí)為解析雨生紅球藻適應(yīng)紫外光的分子機(jī)制提供線索。

關(guān)鍵詞:
  • 紫外抗性蛋白  
  • cdna全長  
  • 結(jié)構(gòu)域  
  • 系統(tǒng)進(jìn)化  
  • 雨生紅球藻  
作者:
張宏江; 抗偉; 馬浩天; 王曉丹; 李潤植; 崔紅利
單位:
山西農(nóng)業(yè)大學(xué)分子農(nóng)業(yè)與生物能源研究所; 山西太谷030801
刊名:
西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)

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