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基于轉(zhuǎn)錄組測序探索創(chuàng)傷弧菌MO6-24/O小RNA

摘要：目的:基于轉(zhuǎn)錄組測序注釋,探索創(chuàng)傷弧菌MO6-24/O小RNA(sRNA)。方法:在海洋培養(yǎng)基2216E中培養(yǎng)創(chuàng)傷弧菌MO6-24/O,收集從對數(shù)生長期到靜止期不同時間點的細菌,提取細菌RNA,通過富集sRNA以及去除核糖體RNA進行建庫和測序,然后將讀段匹配到創(chuàng)傷弧菌MO6-24/O基因組并進行注釋,最后進行驗證。結(jié)果:發(fā)現(xiàn)59個順式編碼sRNA、102個反式編碼sRNA,并進行了部分驗證。結(jié)論:鑒定出創(chuàng)傷弧菌MO6-24/OsRNA。

關鍵詞：
  • 創(chuàng)傷弧菌  
  • 小rna  
  • 轉(zhuǎn)錄組測序  
作者：
周亞男; 李宗城; 張曉彤; 胡成進; 應曉敏; 曹源
單位：
濰坊醫(yī)學院醫(yī)學檢驗學系; 山東濰坊261053; 解放軍第九六〇醫(yī)院實驗診斷科; 山東濟南250031; 解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學中心南院區(qū)腫瘤學研究室; 北京100071; 軍事醫(yī)學研究院軍事認知與腦科學研究所; 北京100850
刊名：
生物技術通訊

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期刊名稱：生物技術通訊

生物技術通訊雜志由軍事醫(yī)學科學院生物工程研究所主辦，軍事醫(yī)學科學院主管的學術刊物，國內(nèi)刊號為：11-4226/Q。創(chuàng)辦于1989年，雙月刊，在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。其主要欄目有：研究報告、技術方法、綜述、其他等。