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吉陶單極蟲可分泌蛋白酶基因的克隆與生物信息學(xué)分析

摘要:粘孢子蟲為魚類主要的寄生蟲,給漁業(yè)的生產(chǎn)造成嚴(yán)重的危害。近年來,粘孢子蟲的蛋白酶以及抑制劑在入侵和感染宿主中的作用被越來越多的報道。在前期粘孢子蟲吉陶單極蟲轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上,成功克隆了3個可分泌蛋白酶基因:TK Papain-1、TK Papain-2和TK Pepsin,并且通過異源表達得到了與預(yù)測蛋白大小相符的蛋白。通過生物信息學(xué)的分析發(fā)現(xiàn),TK Papain-1、TK Papain-2屬于Papain (C1A)家族成員,均編碼半胱氨酸蛋白酶,分別編碼150個和322個氨基酸,蛋白大小為17.06 kDa和36.7 kDa;TK Pepsin編碼天冬氨酸蛋白酶,編碼491個氨基酸,編碼蛋白理論大小為55.41 kDa。3個可分泌蛋白酶均有信號肽序列,為可分泌蛋白;通過進化樹的構(gòu)建,發(fā)現(xiàn)與???、水螅、纖毛蟲同源序列親緣關(guān)系較近。通過多序列比對,找到了可分泌蛋白酶的保守位點。研究結(jié)果為進一步深入粘孢子蟲蛋白酶性質(zhì)及感染機制方面的研究提供了基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞:
  • 粘孢子蟲  
  • 蛋白酶  
  • 生物信息學(xué)分析  
  • 克隆  
  • 表達  
作者:
張鳳麗; 楊雅麟; 夏銳; 高辰辰; 李棟; 冉超; 張震; 張洪玲; 周志剛
單位:
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院飼料研究所; 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部飼料生物技術(shù)重點實驗室; 北京100081; 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院飼料研究所; 中國-挪威魚類消化道微生物聯(lián)合實驗室; 北京100081
刊名:
生物技術(shù)進展

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期刊名稱:生物技術(shù)進展

生物技術(shù)進展雜志緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:33-1375/Q。堅持指導(dǎo)性與實用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于2011年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。