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龍眼MSIL全基因組鑒定及表達(dá)分析

摘要:MSIL(Muliticopy suppressor of IRA homolog1-Like)基因是WD重復(fù)蛋白的一個(gè)亞家族,在植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要的作用。為了解龍眼MSIL(DlMSIL)基因家族的生物學(xué)功能,本研究基于基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用生物信息學(xué)分析法對(duì)DlMSIL基因成員進(jìn)行鑒定,并進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及理化性質(zhì)分析、系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建、啟動(dòng)子順式作用元件分析、龍眼體胚階段和不同組織器官表達(dá)情況以及GA3處理下的定量表達(dá)分析。結(jié)果表明:DlMSIL基因家族含有6個(gè)成員屬于WD40和CAF1C_H4-bd超家族,可分為3類;DlMSIL蛋白編碼393~551 aa,等電點(diǎn)為4.68~7.62,該家族成員均不屬于分泌蛋白;基因家族成員的內(nèi)含子數(shù)目在4~14之間;DlMSIL啟動(dòng)子序列包含大量非生物脅迫響應(yīng)元件及MYB結(jié)合位點(diǎn),推測(cè)DlMSIL基因家族可能參與多種非生物脅迫反應(yīng);DlMSIL可能參與不同胚胎的發(fā)育過(guò)程和不同組織器官的形態(tài)建成。GA3處理下的表達(dá)分析顯示高濃度時(shí),DlMSI1a與DlMSI1c的表達(dá)受到了一定的抑制,而DlMSI4a的表達(dá)量呈現(xiàn)先下降后上升再下降的趨勢(shì),推測(cè)DlMSIL可能參與激素響應(yīng)途徑。本研究表明,DlMSIL基因家族成員可能參與胚胎發(fā)育、激素信號(hào)通路以及非生物脅迫反應(yīng)等多種生物學(xué)功能,體現(xiàn)了龍眼MSIL基因家族功能具有多樣性。

關(guān)鍵詞:
  • 龍眼  
  • 體胚  
  • msil  
  • 生物信息學(xué)分析  
  • qpcr  
作者:
許小瓊; 陳曉慧; 申序; 徐小萍; 林玉玲; 賴鐘雄
單位:
福建農(nóng)林大學(xué)園藝植物生物工程研究所; 福建福州350002
刊名:
熱帶作物學(xué)報(bào)

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熱帶作物學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:46-1019/S。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1980年,雜志在全國(guó)同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。