摘要:R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子參與植物眾多生命活動(dòng)的調(diào)控,在植物生長發(fā)育中至關(guān)重要。本研究采用生物信息學(xué)分析方法,從菠蘿基因組中篩選鑒定R2R3-AcMYB轉(zhuǎn)錄因子,并對(duì)其基因結(jié)構(gòu)、編碼蛋白和系統(tǒng)進(jìn)化進(jìn)行了分析;基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和熒光定量PCR分析,研究了乙烯利處理后菠蘿頂端分生組織MYB基因的表達(dá)模式。研究結(jié)果顯示,菠蘿基因組含有103個(gè)R2R3-AcMYB轉(zhuǎn)錄因子,其中67個(gè)的基因結(jié)構(gòu)組成為3(外顯子)+2(內(nèi)含子),17個(gè)為2(外顯子)+1(內(nèi)含子)。103個(gè)R2R3-AcMYB蛋白中,有31個(gè)偏堿性,55個(gè)顯酸性和17個(gè)呈中性。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)顯示,有67個(gè)編碼蛋白定位于細(xì)胞質(zhì),20個(gè)定位于細(xì)胞核。保守基序分析發(fā)現(xiàn),有91個(gè)R2R3-AcMYB的序列包含SANT結(jié)構(gòu)的motif 1和motif 2。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,81個(gè)R2R3-AcMYB轉(zhuǎn)錄因子可以分別被歸入18個(gè)亞組,其余22個(gè)R2R3-AcMYB轉(zhuǎn)錄因子則未能進(jìn)行明確歸類?;谵D(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和熒光定量PCR分析結(jié)果,發(fā)現(xiàn)菠蘿頂端分生組織中多個(gè)MYB基因的表達(dá)受到乙烯利的誘導(dǎo)或抑制,暗示這些基因可能參與了乙烯利誘導(dǎo)條件下菠蘿生長發(fā)育(包括開花誘導(dǎo)等)調(diào)控。這些研究結(jié)果為進(jìn)一步挖掘菠蘿激素響應(yīng)、生長發(fā)育和開花調(diào)控等基因,揭示菠蘿生長發(fā)育調(diào)控機(jī)制提供了數(shù)據(jù)支持。
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