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香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因組鑒定及表達(dá)分析

摘要:苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase,PAL)是催化苯丙烷代謝途徑第1步反應(yīng)的限速酶,廣泛地參與植物生長發(fā)育過程中的各種生理活動。本研究通過生物信息學(xué)分析,從香蕉A基因組數(shù)據(jù)庫中利用BLASTp篩選出53個可能的MaPAL編碼蛋白序列。在NCBI分析蛋白保守結(jié)構(gòu)域,發(fā)現(xiàn)僅有8個基因具有典型的PAL家族基因的特性。聚類分析結(jié)果表明香蕉MaPAL家族的8個基因可以分為Class I和Class II兩類。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明,所有MaPAL基因在果實發(fā)育階段高表達(dá),MaPAL5參與果實采后成熟過程。在干旱、低溫、鹽處理的香蕉幼苗葉片中,MaPAL1、MaPAL2、MaPAL3、MaPAL4和MaPAL5成員均顯著上調(diào)表達(dá),MaPAL6號成員顯著下調(diào)表達(dá),這些成員參與香蕉響應(yīng)上述非生物脅迫過程。8個MaPAL成員在枯萎病菌處理下均顯著下調(diào)表達(dá),表明在感病品種巴西蕉根系中,MaPAL基因的表達(dá)全部被Foc TR4抑制。本研究結(jié)果為分析MaPAL基因家族在香蕉果實品質(zhì)形成和響應(yīng)逆境中的作用提供了理論依據(jù)。

關(guān)鍵詞:
  • 香蕉  
  • 苯丙氨酸解氨酶  
  • 系統(tǒng)進(jìn)化分析  
  • 表達(dá)分析  
  • 基因家族  
作者:
楊會曉; 孫媛媛; 賈彩紅; 金志強(qiáng); 徐碧玉; 王卓
單位:
中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部熱帶生物技術(shù)重點(diǎn)實驗室; 海南???71101; 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院; 江蘇南京210095
刊名:
熱帶作物學(xué)報

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期刊名稱:熱帶作物學(xué)報

熱帶作物學(xué)報緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:46-1019/S。堅持指導(dǎo)性與實用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1980年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。