摘要：利用紫扇貝與海灣扇貝的雜交扇貝作為試驗對象,通過轉錄組測序對紫海雜交一代扇貝EST(expressed sequence tags)序列進行挖掘、驗證,分析微衛(wèi)星(simple sequence repeats,SSR)在這些序列中的總體分布特征,開發(fā)紫海雜交一代扇貝EST-SSR引物。結果顯示,紫海雜交扇貝的基因組中含有大量的微衛(wèi)星DNA,且種類豐富。各種類型出現(xiàn)的頻率相差很大,在1~6核苷酸重復基元中,1~2核苷酸是主要重復類型,占總SSR的92.75%。三核苷酸重復序列占比較少,為SSR總數(shù)的6.00%,四核苷酸重復序列、五核苷酸重復序列和六核苷酸重復序列的比例僅為1.25%。應用20個雜交一代個體對20對微衛(wèi)星引物進行PCR擴增篩選,其中13對引物顯示出多態(tài)性,共檢測到36個等位基因,每個位點的等位基因變化從2個到4個不等(平均每個位點2.77),平均觀測雜合度( Ho )為0.67,平均期望雜合度為( He )0.53,多態(tài)信息含量( PIC )變化范圍為0.32~0.69,平均多態(tài)信息含量( PIC )為0.44。表明紫海雜交一代扇貝保持了較高的遺傳多樣性。試驗獲得的EST-SSR引物,可用于紫海雜交一代扇貝的種質資源開發(fā)、定向選育及遺傳結構研究。
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