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青稞葉綠體基因RNA編輯位點(diǎn)的預(yù)測(cè)、鑒定與比較分析

摘要:為了闡明青稞葉綠體基因組RNA編輯位點(diǎn)的組成與特性,首先利用生物信息工具對(duì)青稞葉綠體基因的RNA編輯位點(diǎn)進(jìn)行了預(yù)測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)了35個(gè)分布于15個(gè)基因的編輯位點(diǎn),所有編輯均為C到U的轉(zhuǎn)換,其中基因ndhB包含的編輯位點(diǎn)數(shù)量最多,達(dá)9個(gè),這與其他麥類作物相似;進(jìn)一步利用RT-PCR結(jié)合克隆測(cè)序,對(duì)預(yù)測(cè)的35個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)18個(gè)編輯位點(diǎn)被證實(shí)發(fā)生了C到U的編輯;對(duì)編輯前后編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了比較分析,發(fā)現(xiàn)RNA編輯引起了編碼蛋白的結(jié)構(gòu)變化,暗示RNA編輯可以造成編碼蛋白功能的改變。最后,將青稞葉綠體基因RNA編輯位點(diǎn)與栽培大麥、野生大麥的葉綠體RNA編輯位點(diǎn)進(jìn)行了比較,發(fā)現(xiàn)青稞與栽培大麥的RNA編輯組成完全一樣,而野生大麥缺失了ndhA-563位點(diǎn),初步印證了大麥的起源進(jìn)化關(guān)系。

關(guān)鍵詞:
  • 青稞  
  • 葉綠體  
  • rna編輯  
作者:
昌西; 裴悅; 胡凡; 任苗苗; 王彤; 聶小軍
單位:
西藏農(nóng)牧學(xué)院植物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院; 西藏林芝860000; 西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院; 陜西楊凌712100
刊名:
麥類作物學(xué)報(bào)

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麥類作物學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:61-1359/S。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1981年,雜志在全國(guó)同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。