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肥胖合并急性心肌梗死患者血小板基因表達(dá)譜分析

摘要:目的:比較分析急性心肌梗死首次發(fā)作人群中,BMI正常的患者與肥胖患者之間血小板基因表達(dá)的差異性,并探討這些基因?qū)毙孕募」K揽赡茉斐傻挠绊?。方?從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索獲取患者的芯片數(shù)據(jù),并根據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)中所提供的BMI將患者分為BMI正常組和肥胖組,接著通過(guò)GEO2R篩選出差異表達(dá)基因,并運(yùn)用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO富集分析和KEGG通路分析,然后運(yùn)用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)以及Cytoscape軟件篩選出其中的關(guān)鍵基因。結(jié)果:共篩選出550個(gè)差異基因,其中上調(diào)基因432個(gè),下調(diào)基因118個(gè)。GO富集分析顯示,差異基因主要在膜構(gòu)成、細(xì)胞外基質(zhì)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及GTP酶活性正調(diào)控等功能富集。KEGG分析提示,差異基因主要參與cAMP信號(hào)通路、多巴胺能神經(jīng)突觸、胰島素分泌信號(hào)通路、T細(xì)胞信號(hào)通路和FOX信號(hào)通路的調(diào)控。共篩選出ALB、KDR、HDAC2、IL10、EIF4A3、ERBB4、NRP1、GDNF、NPM1和NUP43等10個(gè)得分較高的基因,其中ALB和KDR為蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)的核心節(jié)點(diǎn)。結(jié)論:血小板基因表達(dá)水平在肥胖和BMI正常患者之間存在明顯差異,這些差異基因可能因BMI升高引起,并可能促進(jìn)急性心肌梗死的發(fā)生。

關(guān)鍵詞:
  • 急性心肌梗死  
  • 肥胖  
  • 血小板  
  • 差異表達(dá)基因  
作者:
劉宏濤; 張彤彤; 張?jiān)? 楊華武; 詹大方; 毛銳; 郭鵬森; 張羽; 劉雁軍
單位:
西南交通大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院成都市第三人民醫(yī)院; 成都610031; 重慶醫(yī)科大學(xué)附屬成都第二臨床醫(yī)學(xué)院實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)研究部; 西南交通大學(xué)附屬醫(yī)院成都市第三人民醫(yī)院普外科; 西南交通大學(xué)附屬醫(yī)院成都市第三人民醫(yī)院肥胖與代謝中心
刊名:
臨床心血管病

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期刊名稱(chēng):臨床心血管病

臨床心血管病雜志緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:42-1130/R。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1985年,雜志在全國(guó)同類(lèi)期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。