摘要：目的使用高通量測序方法探究海鮮樣本菌群組成,為基于宏基因組方法的食品潛在致病風險分析和病原體監(jiān)測提供參考。方法對來自北戴河某海鮮市場的8種海鮮樣本進行16S擴增子測序,使用生物信息學方法對物種組成和微生物多樣性進行分析。結果北戴河不同類型海鮮樣品菌群結構均以變形菌門(Proteobacteria)、浮霉菌門(Planctomycetes)、柔膜菌門(Tenericutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、梭桿菌門(Fusobacteria)、藍藻(Cyanobacteria)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、放線菌門(Actinobacteria)和厚壁菌門(Firmicutes)為主,變形菌門的流行說明具有腐敗風險。樣本間優(yōu)勢菌群存在差異,屬水平棲熱菌屬和假單胞菌屬的存在提示有致病的可能性。同源性序列比對檢測到副溶血弧菌并使用PCR驗證到2例副溶血弧菌陽性。結論該研究分析4種不同類型海鮮樣本的優(yōu)勢菌群及可能的致病風險,并檢測到致病病原副溶血弧菌,可為防控北戴河地區(qū)食源性疾病暴發(fā)提供決策依據(jù)。
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