摘要:bHLH是真核生物中一類編碼轉錄調控因子的基因家族,在植物生長發(fā)育中具有重要的調控作用。通過對西洋參根、葉、花蕾樣品進行轉錄組測序,篩選其中的bHLH家族基因,利用生物信息學方法對篩選到的基因進行表達模式、蛋白結構、細胞定位及系統(tǒng)進化分析。結果顯示:從西洋參轉錄組中共鑒定得到62個西洋參bHLH家族基因,這些bHLH在根、葉、花蕾中具有4種表達模式。西洋參bHLH亞細胞定位預測主要在細胞核內,所有表達產物均包含HLH結構域。進化分析顯示,西洋參中62個bHLH基因可分為18個亞類,其中第Ⅺ亞族中包含最多的bHLH成員,共包含11個bHLH蛋白;第Ⅲf、Ⅳa、Ⅲ(a+c)、Ⅰb(2)、Orphans、Ⅳb亞族中的成員數量均為1個,其他亞族為2~9個。
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