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健康人群不同年齡組腸道菌群特征預(yù)測模型的研究

摘要:目的利用16S測序數(shù)據(jù)建立健康人年齡段預(yù)測模型,探索不同年齡組腸道菌群特征。方法基于SRA數(shù)據(jù)庫中2016年923例16S測序數(shù)據(jù)篩選特征操作分類單元(operational taxonomic units,OTUs),應(yīng)用隨機(jī)森林算法建立幼兒園學(xué)生、小學(xué)生、中學(xué)生、青年人、中年人、老年人和長壽老人7個(gè)年齡段預(yù)測模型,分析組間菌群差異特征及功能,計(jì)算特征OTUs與組間差異通路的相關(guān)性。結(jié)果基于278個(gè)與年齡變化相關(guān)的OTUs建立隨機(jī)森林年齡段預(yù)測模型,準(zhǔn)確率達(dá)到72.9%;不同年齡組之間存在249個(gè)顯著差異通路,主要是異生素生物降解和代謝、脂質(zhì)代謝和氨基酸代謝通路;在菌群組成和功能層面聚類分析,學(xué)生組和中年人組聚為一類,青年人組、老年人組和長壽老人組聚為一類。結(jié)論預(yù)測模型以及組間聚類結(jié)果均說明學(xué)生組和中年人組腸道菌群相似,老年人、長壽老人與青年人之間的菌群特征更相近。

關(guān)鍵詞:
  • 腸道菌群  
  • 隨機(jī)森林算法  
  • 健康人群  
作者:
趙敏; 吳競; 李叢勇; 趙義名; 薛萬國; 孫剛; 石金龍
單位:
解放軍總醫(yī)院醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心; 北京100853; 解放軍總醫(yī)院第一醫(yī)學(xué)中心消化內(nèi)科; 北京100853
刊名:
解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)

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解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號(hào)為:10-1117/R。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1980年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。