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胃癌轉(zhuǎn)移的分子特征分析及預(yù)后評(píng)估

摘要:目的利用生物信息學(xué)分析轉(zhuǎn)移性胃癌和原位胃癌的在分子水平的差異,揭示轉(zhuǎn)移性胃癌進(jìn)展機(jī)制,為精準(zhǔn)診療和預(yù)后評(píng)估提供潛在的分子靶點(diǎn)。方法從TCGA公共數(shù)據(jù)庫獲取胃癌患者RNA-Seq及DNA甲基化芯片數(shù)據(jù),篩選轉(zhuǎn)移性胃癌和原位胃癌在兩個(gè)組學(xué)維度的一致性差異基因,評(píng)估其功能及富集通路并進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)回歸分析。結(jié)果篩選出一致性差異基因170個(gè),轉(zhuǎn)移組上調(diào)基因52個(gè)、下調(diào)基因118個(gè)。功能分析提示免疫調(diào)節(jié)、細(xì)胞分化、外源信號(hào)感應(yīng)、自噬與溶酶體轉(zhuǎn)運(yùn)、藥物及蛋白代謝等信號(hào)通路與轉(zhuǎn)移性胃癌發(fā)生有關(guān)。針對(duì)上述基因進(jìn)行預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,發(fā)現(xiàn)RTP3、GTF3C5、TMEM102、NHLRC3、FUT2、PGAP2、AAMP是與轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的7個(gè)關(guān)鍵基因,其聯(lián)合表達(dá)信號(hào)可用于胃癌患者的預(yù)后評(píng)估。結(jié)論由7個(gè)關(guān)鍵基因組成的聯(lián)合因子可為胃癌預(yù)后評(píng)估提供依據(jù),是臨床檢測(cè)的潛在生物學(xué)標(biāo)記物。

關(guān)鍵詞:
  • 胃癌  
  • 轉(zhuǎn)移  
  • 分子標(biāo)記  
  • 差異基因  
作者:
陳奇; 武惠韜; 孫金秀; 薛萬國; 石金龍
單位:
解放軍總醫(yī)院醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心; 北京100853
刊名:
解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)

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