摘要：為探明短密木霉(Trichoderma brevicom pactum)降解咪唑乙煙酸的分子機制,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析篩選降解咪唑乙煙酸的候選基因。結(jié)果顯示:以500mg/kg咪唑乙煙酸馴化后的短密木霉為材料,分別在基礎(chǔ)培養(yǎng)基和以咪唑乙煙酸為單一碳源的培養(yǎng)基中培養(yǎng)至降解效率最高的第7天,在轉(zhuǎn)錄組學(xué)中差異表達的基因1329個,其中上調(diào)703個,下調(diào)626個。用ITRAQ進行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定到21883條肽段和4003個蛋白質(zhì)。關(guān)聯(lián)分析中,鑒定出24個在轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組中均差異表達的基因,其中14個基因上調(diào),10個基因下調(diào)。定量蛋白質(zhì)和基因的表達關(guān)聯(lián)系數(shù)為-0.0472,顯著差異蛋白質(zhì)和顯著差異基因表達關(guān)聯(lián)系數(shù)為-0.1420,蛋白質(zhì)和表達變化趨勢相同的基因關(guān)聯(lián)系數(shù)為-0.7413,蛋白質(zhì)和表達變化趨勢相反的基因關(guān)聯(lián)系數(shù)為-0.7916。關(guān)聯(lián)分析鑒定的24個基因中,有2個基因具有功能注釋,分別為TBU3981A(NCBInr:綠色木霉Gv29-8糖苷水解酶16家族部分mRNA)和TBU1425A(NCBInr:HEX-1),可作為降解咪唑乙煙酸的候選基因。
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