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病毒感染海洋球石藻Emiliania huxleyi的轉(zhuǎn)錄組分析

摘要:海洋球石藻Emiliania huxleyi及其特異性裂解病毒E.huxleyi virus(EhVs)在調(diào)節(jié)海洋碳、硫循環(huán)及全球氣候變化中起著重要作用,也是開(kāi)展真核生物病毒–宿主相互作用研究的良好模型系統(tǒng)之一。為了探究病毒感染條件下E.huxleyi基因表達(dá)水平的變化,以海洋球石藻E.huxley–BOF 92及其專(zhuān)一性裂解病毒EhV-99B1為研究對(duì)象,利用Illumina HiSeq 2000高通量測(cè)序技術(shù),分別對(duì)E.huxleyi病毒感染組(Exp)和非感染對(duì)照組(Con)6 h和45 h的藻細(xì)胞樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。共得到32909條平均長(zhǎng)度為1153 bp的基因。病毒感染6 h和45 h分別得到2617和5229個(gè)差異表達(dá)基因,其中共差異表達(dá)基因465個(gè)。隨機(jī)選取10條差異表達(dá)基因,采用qRT-PCR進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,結(jié)果證實(shí)轉(zhuǎn)錄組分析可靠。GO功能注釋和KEGG通路富集,發(fā)現(xiàn)大量基因與氧化應(yīng)激反應(yīng)、脂類(lèi)代謝、碳水化合物代謝及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等代謝過(guò)程相關(guān),其中變化最顯著的是谷胱甘肽代謝途徑。從病毒感染球石藻轉(zhuǎn)錄組中篩選出部分與氧化應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)的基因,其中9個(gè)基因顯著上調(diào),11個(gè)基因顯著下調(diào),表明宿主能夠通過(guò)體內(nèi)的氧化應(yīng)激反應(yīng)響應(yīng)病毒脅迫。

關(guān)鍵詞:
  • 海洋球石藻e(cuò)miliania  
  • huxleyi  
  • 病毒感染  
  • 轉(zhuǎn)錄組  
  • 差異表達(dá)基因  
  • 氧化應(yīng)激反應(yīng)  
作者:
田雪; 蔡偉聰; 蘇金凈; 吳書(shū)燕; 劉靜雯
單位:
集美大學(xué)食品與生物工程學(xué)院; 福建廈門(mén)361021; 福建省食品微生物與酶工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 福建廈門(mén)361021
刊名:
海洋學(xué)報(bào)

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期刊名稱(chēng):海洋學(xué)報(bào)

海洋學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:11-2055/P。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1979年,雜志在全國(guó)同類(lèi)期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。