摘要：以毛泡桐(Paulownia tomentosa)病苗(Pto)和健康苗(PtoI)為試驗材料,利用高通量測序技術(shù)對染病前后毛泡桐的葉綠體全基因組進行測序,分析比較基因組結(jié)構(gòu)。研究結(jié)果表明,毛泡桐病苗和健康苗的葉綠體基因組由反向重復(fù)區(qū)(IRs)、長單拷貝序列區(qū)(LSC)和短單拷貝序列區(qū)(SSC)等部分組成。其中,葉綠體基因組全長分別為154 700 bp(Pto)和154 646 bp(PtoI),IRs的長度為25 779 bp,LSC和SSC長度分別為85 356、17 786 bp(Pto)和85 356、17 732 bp(PtoI)。生物信息學(xué)分析表明,在Pto中共搜索到簡單重復(fù)位點(SSR)64個,單核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸和五核苷酸的數(shù)量分別為49、5、2、7、1個;PtoI中共有64個SSR位點,單核苷酸個數(shù)為49個,并未發(fā)現(xiàn)六核苷酸。大多數(shù)位點都富含A-T,具有堿基偏好性。
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