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小麥細(xì)胞分裂素受體基因TaHK1的生物信息學(xué)及表達(dá)特性分析

摘要:細(xì)胞分裂素在植物發(fā)育和應(yīng)對(duì)鹽漬、干旱等非生物脅迫的過(guò)程中均扮演著重要的角色。為了研究小麥細(xì)胞分裂素受體基因的功能,利用已知的擬南芥細(xì)胞分裂素受體基因AHK4(At2g01830)為參考序列,使用同源克隆的方法從小麥基因組中得到同源性最高的基因TRIAE_CS42_4DS_TGACv1_362760_AA1181940(EnsemblPlants),命名為T(mén)aHK1。生物信息學(xué)分析表明,TaHK1位于小麥4D染色體上,編碼的蛋白由996個(gè)氨基酸組成,分子質(zhì)量為109.70 ku,等電點(diǎn)為5.71;TaHK1蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)由α-螺旋、無(wú)規(guī)則卷曲、延伸鏈和β-轉(zhuǎn)角4種構(gòu)象組成;亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)該蛋白定位于細(xì)胞膜的可能性較大,跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)其具有2個(gè)跨膜域;蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn),TaHK1具有典型的細(xì)胞分裂素受體的完整結(jié)構(gòu)域,并且含有87個(gè)磷酸化位點(diǎn)。表達(dá)譜分析顯示,TaHK1在根、莖、葉、雄蕊和小穗等各個(gè)組織有廣泛表達(dá);此外,TaHK1表達(dá)量受低磷脅迫和多種病原菌侵染誘導(dǎo),而受干旱脅迫抑制,推測(cè)其在小麥生長(zhǎng)發(fā)育、抵御干旱脅迫和病原菌侵染過(guò)程中可能發(fā)揮重要作用。

關(guān)鍵詞:
  • 小麥  
  • 細(xì)胞分裂素受體  
  • tahk1  
  • 生物信息學(xué)分析  
  • 基因表達(dá)  
作者:
孫麗靜; 趙慧; 呂亮杰; 張穎君; 胡夢(mèng)蕓; 劉茜; 李輝
單位:
河北省農(nóng)林科學(xué)院糧油作物研究所; 河北省作物遺傳育種實(shí)驗(yàn)室; 河北石家莊050035; 河北科技大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院; 河北石家莊050018
刊名:
華北農(nóng)學(xué)報(bào)

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期刊名稱(chēng):華北農(nóng)學(xué)報(bào)

華北農(nóng)學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:13-1101/S。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1986年,雜志在全國(guó)同類(lèi)期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。