摘要：人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是每年引起嬰幼兒和老年人下呼吸道感染的主要病毒性病原,在全球造成了高疾病負(fù)擔(dān),明確RSV流行毒株的遺傳背景是其流行病學(xué)研究和預(yù)防控制的基礎(chǔ)。為了解HRSV蘭州分離株RSV B/LZ11/12的全基因組序列、分子結(jié)構(gòu)特征及遺傳變異情況,本研究對其全基因組進(jìn)行擴(kuò)增克隆和測序后,與GenBank中相關(guān)的參考毒株序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹并進(jìn)行遺傳進(jìn)化及相似性分析。針對其主要蛋白F、G和SH的氨基酸進(jìn)行了比對和差異分析,并對F蛋白的N-糖基化位點(diǎn)進(jìn)行分析。結(jié)果表明B/LZ11/12與B亞型RSV的核苷酸同源性高達(dá)99%以上,其基因組全長15 275bp,具有RSV的所有結(jié)構(gòu)特征。遺傳進(jìn)化分析顯示,B/LZ11/12與B/GZ/13-730、B/England138/2016和SC2225同屬于一個(gè)分支,提示親緣關(guān)系最近。G基因遺傳進(jìn)化樹表明該毒株屬于RSV B亞型BA9基因型。主要氨基酸位點(diǎn)分析顯示該毒株的G基因和F基因均具有一個(gè)特有的變化,即Glu87Gly和Val243Ala的氨基酸替換。F蛋白N-糖基化位點(diǎn)分析顯示該毒株具有RSV F蛋白的5個(gè)共有修飾位點(diǎn),即27~30(NITE)、70~73(NGTD)、116~119(NYTI)、120~123(NTTK)和126~129(NVSI)。相似性分析表明整個(gè)基因組最易變異的區(qū)域在SH和G基因,其次是NS1、NS2和L基因的3′端。本研究首次獲得了RSV B/LZ11/12蘭州分離株全基因組序列,并闡明了其基因組分子結(jié)構(gòu)特征,該結(jié)果對RSV病毒的基因及氨基酸數(shù)據(jù)庫進(jìn)行了數(shù)據(jù)補(bǔ)充,也為我國RSV流行病學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行了補(bǔ)充。
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